上个世纪90年代初期，任天堂和世嘉之间的竞争，是整个游戏行业最为激烈的了。两家公司都采用拼命的商业策略和激进营销行为，随着90年代初期到中期世嘉挑战当时游戏主机行业无可争议的王者，他们之间的敌对和竞争进入到了白热化阶段。
“他们太狠了。”前世嘉北美分公司首席执行官汤姆·凯林斯克(Tom Kalinske，凯林斯克在1990~1996年任世嘉北美分公司CEO)说，“我不得不承认这是他们的长处。我尊敬他们控制整个市场的强烈意愿，但我觉得，他们做的很多事情都非法的。那真的是垄断行为。”
凯林斯克所指的垄断行为，包括任天堂试图控制ROM内存芯片市场，向第三方开发商和零售商施压，不允许他们面向世嘉硬件发布游戏，或是销售世嘉的硬件。凯林斯克认为这导致了游戏行业两个庞大势力之间的斗争升级，而竞争还蔓延到了两家公司的“吉祥物”：马里奥和索尼克。马里奥称得上是现代平台游戏的教父，作为在很多方面采用相同模式的挑战者，索尼克经常被人们拿来与马里奥做比较。
索尼克系列游戏的开发团队似乎始终将马里奥游戏视为自己竞争的标杆。“在那个时候，很多人认为《超级马里奥兄弟》和整个马里奥系列是最优秀的游戏，尤其是在动作和平台游戏领域。”索尼克系列制作人，目前担任索尼克团队主管的饭冢隆说，“马里奥系列游戏的粉丝数量太多了，然后我们推出了索尼克。这个通体蓝色的角色更酷，游戏视觉风格更亮，索尼克跑得更快，操作也要更好一些——它是一款更紧凑的游戏。”
直到90年代中期，索尼克与马里奥齐头并进，但当世嘉推出土星游戏机时，他们尝试制作的第一款3D索尼克游戏《索尼克X-treme》(Sonic X-treme)却被取消开发，未能进入市场。任天堂则推出了具有变革意义的第一款3D化马里奥游戏《超级马里奥64》(Super Mario 64)，并借此扩大了对索尼克的领先优势。马里奥与索尼克之间的竞争开始减弱，不过在1999年，《索尼克大冒险》(Sonic Adventure)与世嘉Dreamcast游戏机同时发售并广受好评，更成为了Dreamcast平台历史上销量最高的游戏作品。
遗憾的是Dreamcast最终以失败收场，《索尼克大冒险》和续作《索尼克大冒险2》虽然受到玩家好评，却无法拯救这款游戏机的命运。2001年，世嘉在《索尼克大冒险2》发售前不久宣布Dreamcast停产，而这也迫使世嘉转变成为一家第三方发行商。
Dreamcast平台上的《索尼克大冒险2》
这一转变影响到了世嘉公司内部的游戏开发流程。此前世嘉的开发人员习惯面向单一平台创作游戏，平台也能通过调整来适应他们的研发需要和诉求——例如在Genesis游戏机加入锁定技术，以及为Dreamcast增加视觉记忆单元(Visual Memory Unit)——不过在那之后，他们再也不可能要求硬件商根据游戏开发的需求调整功能了。
虽然发生了很多变化，但索尼克团队依然对跨平台开发游戏持乐观态度。“世嘉取消硬件业务让人难过，不过也能让索尼克在许多不同平台上奔跑了。”索尼克系列的缔造者中裕司说。
当索尼克团队听说他们可以跨平台开发游戏时，饭冢隆立即向世嘉北美分公司提议，希望让索尼克游戏登陆任天堂的平台。《索尼克大冒险2》(Sonic Adventure 2)是第一款登陆任天堂平台的游戏作品——在2002年，该作被移植到了GameCube游戏机。
由于世嘉和任天堂、索尼克和马里奥在上世纪90年代竞争激烈，当看到这只蓝色刺猬出现在任天堂平台时，很多索尼克粉丝有一种神圣遭到亵渎的感觉。“我觉得从宣传的角度来说，两家公司确实经历了一场大战，竞争不可避免。”饭冢隆说道，“作为硬件制造商，你总是会跟市场上所有其他硬件商竞争，但我的工作只是努力创作最伟大的游戏作品，并且将它们带给更多的人们。”
当阻隔索尼克和马里奥出现在同一个平台的屏障不复存在，世嘉和任天堂都开始考虑让这两个角色出现在同一款游戏中。中裕司最先向世嘉提出了这个建议，不过直到中裕司在2006年离职创办自己的研发工作室，他的梦想还没能得到实现。
中裕司离开世嘉后，两家公司开始商谈，试图找到让马里奥和索尼克这两个特色鲜明的角色出现在同一款游戏的最佳方式。“我总是想，如果索尼克和马里奥出现在一款游戏中，那会特别好。但如果你让两个角色出现在一款动作游戏里，它们带给玩家的速度感完全不一样，所以那行不通。”任天堂设计师兼制作人宫本茂说。
世嘉和任天堂继续集思广益，他们最终提出的解决方案，是创作角色混搭但同时脱离两款游戏世界观的游戏。“我开始跟任天堂谈，后来当我们拿到奥运会的游戏制作授权时，我们就想到，‘我们可以让索尼克和马里奥出现在同一个世界，让它们互相竞争。奥林匹克运动会就是个很好的赛场，因为这些角色可以同时参加比赛。’” 饭冢隆回忆说，“两家公司都觉得让这些角色竞争的主意不错，那是我们的第一次伟大谈话。”
2007年底，《马里奥与索尼克在北京奥运会》(Mario & Sonic at the Olympic Games)登陆Wii游戏机，该作在2008年初登陆了任天堂掌机DS。随后不久，索尼克又和马里奥一起出现在了Wii游戏《任天堂明星大乱斗》(Super Smash Bros. Brawl)中，让见证过上世纪90年代家用主机大战的粉丝们有机会选择自己喜爱的角色并进行对抗。
世嘉和任天堂的合作赢得了成功。每隔两年，他们就会紧随奥运会举办周期，推出一款新的《马里奥与索尼克》奥运游戏——包括《马里奥与索尼克在里约奥运会》。索尼克也频繁现身《任天堂明星大乱斗》，在2014年该作的Wii U和3DS版本中都有亮相，如今已经被视为该系列的主要角色之一。
除了与任天堂的合作之外，世嘉还推出了几款由任天堂平台独占的索尼克系列新作。过去十年，世嘉面向Wii、Wii U、DS和3DS游戏机发布了《索尼克与神秘指环》《索尼克与黑暗骑士》《索尼克：色彩》《索尼克：失落世界》以及《索尼克爆破：崛起之诗》等多款游戏，而在过去几年，世界推出的数款索尼克游戏均由任天堂独占。
如今，索尼克系列在任天堂平台的独占期即将结束，世嘉计划跨平台推出《索尼克：狂欢》(Sonic Mania)和索尼克团队研发的另一款还没有拟定名称的游戏，该作预计2017年问世。
“这段关系让任天堂和我们自己都受益良多，不过索尼克游戏在任天堂的独占将要告一段落，我们对面向所有平台推出游戏感到兴奋。”在前不久被任命为索尼克首席品牌官的伊沃·格斯科维奇(Ivo Gerscovich)说，“他们一直以来都是我们的伟大合作伙伴，两家公司互相尊敬。”
虽然在当下，索尼克和马里奥会经常进行友谊赛，但并非所有人都对他们的合作感到兴奋。作为亲历上世纪90年代家用主机大战的代表人物之一，凯林斯克称当他第一次在任天堂游戏机上看到索尼克时，他“真的很震惊”。
“那确实让我大跌眼镜。”凯林斯克说，“直到今天，我仍然难以接受这家我们曾经拼命对抗的公司，突然成了我们的好兄弟!但他们之间的关系真的非常密切。”
对于世嘉与任天堂的合作，前世嘉北美分公司营销总监艾尔·尼尔森(Al Nilsen)的看法跟凯林斯克一样。“我不能不联想到我们在早期跟任天堂的关系。”尼尔森说，“我们身上都有那个年代战争留下的伤疤。就个人而言，我想不明白索尼克和马里奥为什么能够成为死党。”
2014年的E3展上，当任天堂演示Wii U游戏《任天堂明星大乱斗》时，凯林斯克第一次看到世嘉和任天堂的两大吉祥物走到了一起。他回忆说自己选择了索尼克，对自己能够击败递给他Demo的任天堂代表感到非常高兴。我问凯林斯克，他是否很享受操控索尼克拳打马里奥，他大笑着说道：“是的，这没错!这是梦想成真的时刻!”
这样看来，虽然世嘉和任天堂的竞争关系不可避免地淡化和演变，但在某些人眼里，两家公司之间的敌对永远不会彻底消失。
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